CDはご存知の通り磁気で記録されているのではなく、色素をレーザで焼き付けてその ON、OFFによりデータを記録しています。
この色素の種類によって、色が違います。
ちなみに、どんなのがあるかと言うと、シアニン系 フタロシアニン系 アゾ系 などがあります。